• Procuradoria Geral do Estado;
• Secretaria de Estado da Educação;
• Secretaria de Estado da Administração;
• Universidade de Estado de Santa Catarina;
• Secretaria de Estado da Infraestrutura;
• Agência de Desenvolvimento do Turismo de Santa Catarina - SANTUR;
• Agência de Regulação de Serviços Públicos de Santa Catarina - ARESC;
• Controladoria-Geral do Estado de Santa Catarina - CGE;
• Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa Catarina - FAPESC;
• Fundação Catarinense de Cultura - FCC;
• Fundação Catarinense de Esporte - FESPORTE;
• Fundação Escola do Governo - ENA;
• Instituto de Metrologia de Santa Catarina - IMETRO;
• Instituto de Previdência do Estado de Santa Catarina - IPREV;
• Junta Comercial do Estado de Santa Catarina - JUCESC;
• Secretaria da Agricultura, da Pesca e do Desenvolvimento Rural - SAR;
• Secretaria de Estado da Comunicação - SECOM;
• Secretaria de Estado da Defesa Civil;
• Secretaria Executiva da Integridade e Governança - SIG;
• Secretaria de Estado do Desenvolvimento Econômico - SDE;
• Secretaria de Estado do Desenvolvimento Social - SDS.

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Unidades Descentralizadas da SES

• Hospital Governador Celso Ramos – HCR;
• Hospital Regional Homero de Miranda Gomes – HRSJ;
• Hospital Dr. Waldomiro Colautti – HWC;
• Hospital e Maternidade Tereza Ramos;
• Hospital Infantil Joana de Gusmão – HIJG;
• Hospital Nereu Ramos – HNR;
• Hospital Regional Hans Dieter Schmidt - HRHDS;
• Instituto de Cardiologia de Santa Catarina – ICA;
• Instituto de Psiquiatria – IPQ;
• Laboratório Central – LACEN;
• Maternidade Carmela Dutra - MCD;
• Maternidade Darcy Vargas – MDV;
• Maternidade Dona Catarina Kuss – MDCK.